Fremont, California, 28 de Enero de 2003- ¡ABIT
ha formado un equipo Folding@Home y le invita a unirse a él! Todos los que
quieran contribuir a nuestro equipo con sus unidades de trabajo deberán poner el
número de ABIT en la configuración de su programa cliente. El número del Equipo
ABIT es el 13285. Para hacer la configuración, después de
descargar el programa cliente, pulse con el botón derecho en el icono F@H de su
escritorio y seleccione "Configurar...". En la opción "User Name" ("Nombre de
usuario") ponga su nombre o un nombre a su gusto, y después ponga el número de
equipo de ABIT (13285) en la opción "Team Number" ("Número de
equipo"). Para asegurarse de que está participando en el proyecto Folding vaya a
la pestaña "Advanced" ("Avanzado") y, abajo, en la opción "client type",
seleccione: "Folding@Home".
El Problema Más Complejo de la Biología - Del Genoma a la Estructura
Ahora que disponemos de un mapa del genoma humano, lo que realmente necesitamos
saber no sólo es qué genes codifican a qué proteínas, sino también cómo se
forman dichas proteínas. Ahora el mayor reto es solucionar el que probablemente
sea el problema más complejo de la biología - cómo se pliegan las proteínas.
Como uno de los más penetrantes e importantes elementos de la naturaleza, las
proteínas llegan a existir mediante un procedimiento único: se hacen a sí mismas.
Este proceso es denominado "plegamiento", y cómo sucede puede decirnos mucho
sobre sus funciones. Es un proceso que aún no se comprende, y dominar esta
fuerza misteriosa ha sido una especie de "Santo Grial" para los científicos.
¡Vamos, Ahora Todos Juntos!
Para llevar a cabo esta tarea, un equipo de la Universidad de California en
Stanford ha creado un programa de computación distribuida que pretende unir la
potencia de computación conjunta de todas esas computadoras ociosas. Basándose
en el modelo SETI@home, el equipo, empleando el programa de computadora
Fold@Home, espera
romper la "barrera del microsegundo".
¿La Qué?
Ante todo, tiene que reconsiderar completamente su idea de "rápido". No es sólo
el hecho de que se ensamblen a sí mismas lo que hace especiales a las proteínas,
sino que además lo hacen a una velocidad tremenda, algunas tan rápidamente como
en una millonésima de segundo. Y el sitio web explica que, aunque esto es
ciertamente rápido para usted y para mí, "resulta notablemente largo de
simular para las computadoras. De hecho, existe una diferencia de orden de
magnitud de 1.000 entre la escala temporal de simulación (nanosegundos) y el
tiempo que tardan en plegarse las proteínas más rápidas (microsegundos)".
Cada etapa del proceso de plegamiento es increíblemente compleja, como explica
el Dr. Vijay Pande, profesor adjunto de química en la Universidad de Stanford e
investigador principal del proyecto: "Existen tantas variables y tantos
cálculos a realizar en un período de nanosegundos que un PC sencillamente no
puede estar a la altura".
Empleando el modelo de computación distribuida, el equipo de Stanford espera
simular el plegamiento de proteínas para comprender cómo se pliegan las
proteínas tan rápida y fiablemente. Según Pande, "Una vez que conoces su
forma, puedes adivinar lo que hacen. Su estructura nos dice mucho sobre lo que
pueden hacer y cómo se unen entre sí".
Una Solución: DINÁMICA DISTRIBUIDA
Para resolver el problema del plegamiento de proteínas,
su grupo ha desarrollado
un nuevo método para simular el plegamiento de proteínas que puede romper la
barrera del microsegundo mediante la distribución del trabajo entre múltiples
procesadores de una forma nueva - con un aumento casi lineal de la velocidad con
el número de procesadores. De este modo, con 1.000 procesadores, pueden romper
la barrera del microsegundo y desvelar
el misterio de cómo se
pliegan las proteínas.
Como señala el artículo de la revista Wired, las proteínas simples se ensamblan
en aproximadamente 10.000 nanosegundos, y una computadora de 400MHz puede
simular 1 nanosegundo de tiempo de ensamblamiento en aproximadamente un día,
dice Pande. Esto significa que se necesitarían 1.000 participantes para simular
el plegamiento de una proteína en 10 días, y eso sólo para plegamientos simples.
Las proteínas más complejas pueden llevar mucho más tiempo.
Como explica el equipo de Stanford en su sitio web; "este método es
extremadamente exigente a nivel computacional y necesitamos su
ayuda."
¿Quién se Beneficia de Esto?
¡Todos nosotros! Al contrario que en otros proyectos de computación distribuida,
Folding@home está administrado por una institución académica, el
Pande Group, en el
Departamento de Química de
la Universidad de Stanford. Han subido
películas e imágenes de todas las operaciones de plegamiento a su web (consulte
los resultados actuales aquí). Se actualizan diariamente, e incluyen
información sobre qué usuarios han contribuido a qué operación.
Puede ir al siguiente sitio para saber más y descargar el programa:
http://folding.stanford.edu/download.html
Es gratuito y muy pequeño, se ejecuta en segundo plano y nunca ocupa recursos
cuando son necesitados por cualquier otro programa. ¡Simplemente deje que se
ejecute y olvídese de él!
Todos los que quieran contribuir a nuestro equipo con sus unidades de trabajo
deberán poner el número de ABIT en la configuración de su programa cliente. El
número del Equipo ABIT es el 13285. Para hacer la configuración, después de
descargar el programa cliente, pulse con el botón derecho en el icono F@H de su
escritorio y seleccione "Configurar...". En la opción "User Name" ("Nombre de
usuario") ponga su nombre o un nombre de su gusto, y después ponga el número de
equipo de ABIT (13285) en la opción "Team Number" ("Número de equipo"). Para
asegurarse de que está participando en el proyecto Folding vaya a la pestaña
"Advanced" ("Avanzado") y, abajo, en la opción "client type", seleccione: "Folding@Home".
ABIT Computer Corporation diseña y vende una completa familia de premiadas
placas base y productos multimedia que soportan tecnologías líderes en la
industria, y brinda calidad y rendimiento de primera para la integración de
sistemas de componentes de informática, soportando un amplio rango de
aplicaciones del PC tales como comercio electrónico, negocio electrónico,
entretenimiento y educación. La sede de la corporación está en Taiwán. Para más
información, visite el sitio web de la compañía en
http://www.abit.com.tw
Sitio Web de ABIT Corp.:
http://www.abit-usa.com
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