Fremont - Californie, 28 Janvier 2003 - ABIT
a créé une équipe Folding@Home et vous invite à la rejoindre! Toutes personnes
qui souhaitent contribuer à notre équipe en apportant du temps de calcul devront
entrer le numéro d'identification ABIT dans la configuration de leur client. Le
numéro de l'équipe ABIT est: 13285. Pour le configurer après
l'avoir téléchargé, clique droit sur l'icône F@H dans la barre de tache et
choisissez « configurer ». Dans la section *User Name* entrez votre nom ou
n'importe quel pseudonyme que vous appréciez. Entrez ensuite le numéro de
l'équipe ABIT 13285 dans le champ "Team Number". Pour être certain
que vous participez bien au projet de recherche, allez dans l'onglet avancé et
en bas au niveau de "client type" choisissez "Folding@Home".
Le plus complexe des problèmes de biologie - Du génome à la structure.
Maintenant que nous avons séquencé le génome humain, ce que nous avons
besoin de savoir n'est plus quel gène code quelle protéine mais comment ces
protéines sont assemblées. Maintenant le plus grand défi est de résoudre ce qui
est probablement le plus complexe problème de biologie, comment les protéines se
replient-elles ? Bien qu'étant un des éléments les plus répandus dans la nature,
les protéines ont une façon bien particulière de naître, elles se fabriquent
elles-mêmes. Ce procédé est appelé le pliage ou repliement ("folding") et ce
processus pourrait nous apprendre beaucoup sur leur fonctionnement. C'est un
processus qui n'est pas compris et la maîtrise de cette force mystérieuse est
une sorte de *quête du graal* parmi les scientifiques.
Rassemblons nous dès maintenant
Pour accomplir cette tache, une équipe de l'université Stanford de
Californie a créée un programme de calcul distribué qui a pour but de rendre
utile la puissance de calcul collective de tous les ordinateurs non utilisés au
maximum de leurs capacités. Basée sur le modèle de SETI@home, l'équipe
Fold@Home espère
passer la barrière de la microseconde.
Le sujet ?
Tout d'abord, vous devez revoir totalement votre conception de vitesse. Non
Seulement les protéines s'assemblent elles mêmes de manière spéciales mais en
plus à une vitesse formidable, certaines en un millionième de seconde. Le site
Web explique que bien que ça puisse paraître très rapide pour vous, "c'est
remarquablement long à simuler pour des ordinateurs. En fait, il y a un écart de
1000 entre l'échelle de simulation (nanoseconde) et le temps qu'il faut aux
protéines les plus raides pour se replier (microseconde) ".
Chaque étape du processus de repliement est incroyablement complexe. Dr. Vijay
Pande l'assistant professeur de chimie de l'université de Stanford et le
principal investigateur du projet nous explique : *Il y a tellement de
variables et de calculs à effectuer en l'espace d'une nanoseconde que
l'ordinateur n'y arrive pas.*
En utilisant le calcul distribué, l'équipe de Stanford espère simuler la mise en
forme de protéines de manière à comprendre pourquoi les protéines se replient
sur elles-mêmes si vite. D'après le Dr. Pande, "Une fois que vous connaissez
la forme, vous pouvez deviner la fonction. Leurs structures nous permet de
savoir à quoi elles servent et comment elles s'assemblent ".
Une solution: La dynamique distribuée
Pour résoudre le problème de mise en forme des protéines,
leur groupe a développé
un nouveau moyen de simuler qui permet de passer en dessous de la barrière de la
microseconde en divisant le travail par le nombre de processeurs actifs - avec
une vitesse directement proportionnelle au nombre de processeurs. Ainsi, avec
1000 processeurs, ils peuvent passer en dessous de la microseconde et ainsi
percer le mystère du
repliement des protéines.
Comme nous l'indique un article de magasine spécialisé, les protéines simples
s'assemblent en 10 000 nanosecondes et un ordinateur a 400Mhz permet de simuler
1 nanoseconde en environ une journée. Ceci signifie que 1000 participants sont
nécessaires pour simuler une protéine simple en 10 jours. Des protéines plus
complexes peuvent prendre beaucoup plus de temps.
Comme l'explique l'équipe de Stanford sur son site Web, "Cette méthode est
très gourmande en temps de calcul et nous avons besoin de votre
aide."
Qui en bénéficie ?
Nous tous ! Contrairement à d'autres projets de calcul distribué,
Folding@home est dirigée par une institution académique, le
Pande Group, au
département chimie de
l'université de Stanford. Ils ont mis à disposition des animations et des
images de leurs recherche (Les
résultats courants sont ici). Le site est complété chaque jour et indique
quels utilisateurs ont contribués au travail.
Vous pourrez trouver plus d'informations et télécharger le programme ici:
http://folding.stanford.edu/download.html
C'est gratuit et très petit, ça tourne en tache de fond et ne prend jamais de
ressources nécessaires pour autre chose. Vous le lancez et vous l'oubliez !
Toutes personnes qui souhaitent contribuer à notre équipe en apportant du
temps de calcul devront entrer le numéro d'identification ABIT dans la
configuration de leur client. Le numéro de l'équipe ABIT est: 13285. Pour
le configurer après l'avoir téléchargé, clique droit sur l'icône F@H dans la
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certain que vous participez bien au projet de recherche, allez dans l'onglet
avancé et en bas au niveau de "client type" choisissez "Folding@Home".
ABIT Computer Corporation conçoit et vends une gamme complète de cartes mères
récompensée par de nombreux prix ainsi qu'un ensemble de produits multimédia
haute technologie qui apportent la qualité et les performances lors de
l'intégration de composants PC, supportant ainsi un très large éventail
d'applications telles que l'e-commerce, l'e-business, les loisirs et l'éducation.
Le siège d'ABIT Computer Corporation se situe à Taiwan.
Pour plus d'information, visitez le site Web de l'entreprise:
http://www.abit.com.tw |
